Nel 1997, con Capelli, vince il Premio della Critica nelle Nuove Proposte al Festival di Sanremo e pubblica Il Giardinere. Tra il 2000 e il 2006 pubblica Sereno ad Ovest, La Cura del Tempo e Novo Mesto, che contiene Costruire, diventata negli anni uno dei suoi brani più identificativi e più amati.
A novembre 2010 viene pubblicato il singolo Parole Parole cantata da Niccolò Fabi con Mina. Pubblica ad aprile 2016 il nuovo disco Una Somma di Piccole cose a cui segue un tour di presentazione interamente sold out e che fa bissare a Niccolò la Targa Tenco come miglior disco in assoluto. Nel 2017 Niccolò Fabi festeggia i 20 anni di carriera pubblicando Diventi Inventi 1997-2017 e con una grande festa presso il Palalottomatica di Roma. A Settembre 2019 viene rilasciata "Io Sono l'altro", primo brano estratto da "Tradizione e Tradimento", nuovo album di Niccolò, prodotto insieme a Roberto Angelini e Pier Cortese. Segue un tour di 25 concerti che registra esaurito in tutti i teatri.